Вы здесь

Главная

Влияние нуклеотида в 37 положении тРНК на кодон-антикодоновое взаимодействие в А-сайте 70S рибосомы

ID_Статьи: 
33.00

Взаимодействие между кодоном мРНК и антикодоном тРНК является центральным событием в процессе биосинтеза белка на рибосоме. Антикодоновая петля тРНК содержит ряд консервативных и полуконсервативных нуклеотидов; в частности, в подавляющем большинстве молекул тРНК в положении 37 (З'-сосед антикодона) расположен гипермодифицированный пурин. В настоящей работе изучалось влияние природы нуклеотида в

 положении 37 дрожжевой тРНКРЬена ее взаимодействие с А-сайтом 70S рибосом E.coli. С этой целью было проведено

 измерение равновесных и кинетических констант этого взаимодействия для различных видов пептидил-тРНК (нативная дрожжевая тРНКРЬе, содержащая Y-основание (уайбутин) в 37 положении; немодифицированные

 транскрипты дрожжевой тРНКРЬе с основаниями G, A, U и С в положении 37). Полученные количественные данные

 свидетельствуют, что пуриновое основание стабилизирует связывание за счет усиления стэкинг-взаимодействия и вовлечения дополнительных ионов магния во взаимодействие тРНК * рибосома. Аминогликозидный антибиотик

 паромомицин, замещающий ионы Mg2+ в декодирующем центре, значительно стабилизирует связывание тРНК и

 устраняет зависимость сродства тРНК к А-сайту рибосомы от концентрации ионов Mg2+. Замещение пуринов в

 37 положении пиримидинами приводит к увеличению как скорости связывания тРНК с А-сайтом, так и скорости

диссоциации тРНК. По-видимому, взаимодействие тРНК с А-сайтом происходит в две стадии: за быстрым этапом начального связывания тРНК следует, обусловленное наличием пурина в 37 положении, медленное изменение конформации антикодоновой петли и стабилизация кодон-антикодонового взаимодействия за счет усиления стэкинга, связывания дополнительных ионов Mg2+ и усиления взаимодействия между тРНК и 16S рРНК.

 

Коневега А.Л., Катунин В.И.

Петербургский Институт Ядерной Физики РАН, Гатчина (Россия)