Вы здесь

Главная

Уточнение структуры уридинфосфорилазы Salmonella typhiмurium с разрешением 2.5 А

ID_Статьи: 
12.00

Уридинфосфорилаза (Уфаза) входит в состав класса пиримидиновых нуклеозидфосфорилаз и катализирует реакцию расщепления гликозидной связи в уридине с образованием рибозо-1-фосфата и урацила. Нуклеозидфосфорилазы играют важную роль в метаболизме нуклеотидов, обеспечивая клетку пуриновыми и пиримидиновыми основаниями и составляя альтернативу синтезу нуклеотидов de novo. Уфаза из Salmonella typhimurium обладает более широкой субстратной специфичностью и высоким сродством к субстрату, чем ее аналог из Е coli.

На синхротроне DESY в Гамбурге на линии XI3 был собран набор дифракционных данных с разрешением 2.5 А Сбор рентгенодифракционного набора и его обработка проведена программой "XDS", полнота набора составила 98.5%, Rmerge = 8.4%. Упаковку молекул Уфазы в кристалле можно описать пространственной группой Р61 с параметрами элементарной ячейки: а=92.3 A, b=92.3 А, с=267.5 A, Z=6. В качестве стартовой модели для процедуры молекулярного замещения нами используется структура молекулы уридинфосфорилазы Salmonella typhimurium с разрешением 2.9 А . Проведено уточнение структуры Уфазы Salmonella typhimurium с разрешением 2.5 А : Rs =25%, Rfree=30%, среднеквадратичное отклонение от стандартных значений для длин связей - 0.008 А, для валентных углов - 1.5°.

 

Донцова М.В., Габдулхаков А.Г., Гарбер М.Б., Никонов С.В., Михайлов A.M.

1Институт кристаллографии РАН, Москва (Россия)

2Институт белка РАН, Пущино (Россия)