Вы здесь

Главная

Структура гена 18s рРНК морского жгутиконосца Colpodella pontica и филогенетическая реконструкция Alveolata

ID_Статьи: 
83.00

Молекулярно-биологические и ультраструктурные данные свидетельствуют о родстве трех экологически важных групп эвкариот: инфузорий, паразитичес­ких простейших Apicomplexa и фототрофных Dinozoa, объединяемых с недавних пор в надтип Alveolata. Практическое значение Alveolata обусловило при­стальный интерес к этой группе, включая программу полного секвенирования генома Plasmodium - возбудителя малярии. При этом взаимоотношения основ­ных групп Alveolata между собой, а также строение и образ жизни их ближай­шего общего предка, остаются неясными. На роль «живого предка» претендует хищный свободноживущий жгутиконосец Colpodella pontica, у которого обнару­жены элементы апикального комплекса, Мы определили последовательность гена 18S рРНК С. pontica и использовали ее для построения филогенетических деревьев методами NJ, MP и ML. Поученные результаты свидетельствуют, что линия, ведущая к современному виду С. pontica, отделилась на ранних этапах эволюции Alveolata. Наибольшую поддержку получает гипотеза о ее сестринс­ких отношениях с Apicomplexa, таким образом, для последних обнаруживается наиболее родственная внешняя группа, представленная свободноживущими про­тестами. Традиционные группировки Alveolata: Dinozoa, Apicomplexa и Ciliophora получают хорошую статистическую поддержку монофилии только при использовании более точных методов обработки данных, поскольку упро­щенные методы обработки приводят к обособлению сборной группы, в которую попадают представители споровиков (Plasmodium, Gregarina) и динофдагел-лят с наиболее дивергированными последовательностями гена 18S рРНК. Учет гетерогенности нуклеотидных позиций по скоростям эволюции снимает этот эффект «притяжения длинных ветвей».

 

Кувардина О.Н.1 , Алешин В.В.1, Мыльников А.П.2

1 Институт физико-химической биологии им. А.Н. Белозерского, МГУ им. Ломоносова, Москва

2 Институт биологии внутренних вод им. И.Д. Папанина РАН, пос. Борок