Вы здесь

Главная

Сравнительный анализ степени сходства различных функциональных участков белковых последовательностей IL-13 человека, мыши, крысы, быка, свиньи и собаки в сочетании с анализом кодирующих их генов

ID_Статьи: 
170.00

В настоящее время открыты и изучаются интерлейкины-13 (IL-13) человека, мыши, крысы, быка, свиньи и собаки. В базе данных GenBank присутствуют пос­ледовательности мРНК человека, мыши, крысы, быка, свиньи и собаки и последо­вательности генов человека, мыши, быка и свиньи.

Действие интерлейкина-13 на разные типы клеток обладает определенной видо- и тканеспецифичностью. Тканеспецифичность действия IL-13 можно объяс­нить различным субъединичным составом рецептора интерлейкина-13 на по­верхности разных типов клеток.

Одним из подходов к объяснению видоспецифичности действия интерлей­кина-13 является анализ степени сходства различных функциональных участ­ков белковых последовательностей IL-13 разных видов в сочетании с анали­зом кодирующих их генов. Этот анализ также мог бы позволить сделать неко­торые предположения об эволюции гена IL-13.

Обнаружено, что запись AF276990 базы данных EMBL (фрагмент хромосо­мы 4 собаки) предположительно содержит ген интерлейкина-13 собаки, посколь­ку четыре фрагмента данной последовательности показывают 100% гомологии с мРНК интерлейкина-13 собаки. На основе данной гомологии определена пред­положительная экзон-иктронная структура гена интерлейкина-13 собаки.

Проведен сравнительный анализ кодирующих последовательностей мРНК интерлейкина-13 человека, мыши, крысы, быка, свиньи и собаки. Также проведено сравнение функциональных участков (экзоны, интроны, сайты сплайсинга, 5'- и З'-нетранслируемые области) генов IL-13 человека, мыши, быка, свиньи и собаки.

Связь обнаруженных консервативных участков рассмотренных нуклеотид-ных и белковых последовательностей с функциональными участками интерлей­кина-13 обсуждается.

 

Топорова В.А., Петровская Л.Е.

Институт биоорганической химии им. М.М. Шемякина и Ю.А. Овчинникова РАН, Москва