Вы здесь

Главная

Сравнительное исследование аллелей генов Нос и Soc в природной популяции бактериофагов Т4-типа

ID_Статьи: 
150.00

Бактериофаг Т4 кодирует белки Нос и Soc, которые считаются несуществен­ными компонентами капсида бактериофага. При сборке вириона эти белки при­соединяются к уже зрелой головке. Оба белка являются исключительно перспек­тивными носителями для фагового дисплея. На поверхности капсида тримеры белка Soc располагаются вокруг гексамеров gp23*, в центре которых находится Нос, и стабилизируют капсид по механизму застежки молнии. Белок Нос явля­ется основным антигеном вируса и состоит из четырех доменов длиной 94 аминокислоты. Присоединение белка Нос к поверхности капсида, возможно, осу­ществляется засчет С - концевого домена, а N - концевые иммуноглобулинпо-добные домены могут быть экспонированы на поверхности капсида и могут обеспечивать высокую антигенность данного белка. С помощью ПЦР ~ анализа было изучено наличие вариантов генов hoc и soc в природной популяции фа­гов Т4-типа (RB-фаги). У большинства исследованных фагов была обнаружена аллель гена hoc, характерная для фага Т4. Фаги RB15, RB26, RB30 и RB49 содержа­ли в данной области генома фрагмент ДНК большей длины. У фагов RB69 и RB42 ген hoc не был обнаружен. Сравнение генов hoc фагов RB30 и Т4 показа­ло, что у фага RB30 произошла внутригенная дупликация, в результате которой белок Нос приобрел дополнительный домен, на 99% сходный со вторым имму-ноглобулинподобным доменом белка Нос фага Т4. По результатам ПЦР и рес-триктного анализа можно предположить, что бактериофаги RB15, RB26, RB49 не­сут аналогичную аллель этого гена. Было показано, что большинство исследо­ванных фагов содержат аллель гена soc, характерную для Т4; у фагов RB6, RB9, RB32, RB69 данный ген не был обнаружен, а фаг RB2, возможно, содержит в этой области фрагмент ДНК меньшей длины. Можно предположить, что хотя роль белка Нос в стабилизации капсида не ясна, наличие гена hoc является консерва­тивным для данной природной популяции фагов Т4-типа.

 

Сахабутдинова Л .Р.1, Микулкнская Г.В.2, Шляпников М.Г.1, Зимин АА.1

1 Институт биохимии и физиологии микроорганизмов РАН, Пущин о

2 Филиал института биоорганической химии РАН, Пущино