Вы здесь

Главная

Сиквенс 16S рРНК и спектры жирных кислот в полифазном таксономическом анализе бактерий рода Pseudomonas

ID_Статьи: 
46.00

Идентификация изолятов, относящихся к роду Pseudomonas, представляет значительную трудность из-за большого количества описанных к настоящему времени видов, их фенотипического разнообразия и отсутствия четкой и надежной схемы идентификации. Установление их видовой принадлежности часто требует полифазного подхода. Целью данной работы стало сопоставление данных сиквенса 16S рРНК и общего жирнокислотного состава бактерий рода Pseudomonas. Объектами исследований были 9 штаммов псевдомонад с неустановленной видовой принад­лежностью из Украинской Коллекции Микроорганизмов, 14 типовых штаммов различных видов рода Pseudomonas и 6 культур, выделенных нами из образцов, собранных на Украинской антарктической станции "Академик Вернадский" и отнесенных к видам Pseudomonas putida, Pseudomonas fragi и Pseudomonas veronii. Проведен анализ жирнокислотного состава, ПЦР-амплификация и секвенирование гена 16S рРНК. Результаты сиквенса фрагментов гена 16S рРНК, содержащих от 212 до 381 нуклеотидов подтвердили принадлежность исследуемых культур к роду Pseudomonas. Об этом же свидетельствовало наличие в их жирнокислотных спектрах 3-оксидекановой и 3-оксидодекановой кислот - таксономических маркеров рода Pseudomonas. Жирнокислотные профили антарктических штаммов были сходны с жирнокислотными спектрами типовых штаммов соответствующих видов. Жирнокислотные спектры штаммов с неопределенной видовой принадлежностью отличались от спектров исследованных типовых культур, что подтверждает их таксономическую обособленность. Группировка бактерий по составу жирных кислот отражала внутреннюю структуру рода и в целом совпадала с их распределением по определенным комплексам внутри рода Pseudomonas на основании результатов молекулярно-генетических исследований.

 

Коцофляк О.И.

Институт микробиологии и вирусологии НАН Украины, Киев (Украина)