Вы здесь

Главная

Секвенирование и сравнительный анализ внутренних транскрибируемых спейсеров рибосомальных генов ITS1, ITS2 и генов 5.8s рРНК у дикорастущих представителей рода Avena

ID_Статьи: 
69.00

Полиморфизм и сходство геномов представителей рода Avena (Овес), систематическое положение этих злаков относительно друг друга и в системе Роасеае изучали путем секвенирования эволюционно лабильных последовательностей ITS1 и ITS2 и эволюционно консервативных последовательностей генов 5.8S-pPHK. В качестве праймеров для ПЦР-амплификации исследуемого участка геномов использовались параймеры ITS1F 5'-cttggtcatttagaggaagtaa-З' и ITS4 5'-tcctccgcttattgatatgc-З'. Были амплифицированы и секвенированы последовательности из образцов геномной ДНК A. wiestii (геном As, VIR-95, Алжир), A. hirtula (As, VIR-2, Алжир; VIR-2034, Тунис), A. longiglumis (Al, VIR-1811, Марокко), A. damascene (Ad, VIR-2057, Марокко), A. canadensis (Ac, VIR-1811, Алжир), A. atlantica (As, VIR-1894, Марокко) и Не­последовательности тетраплоидного вида A. macrostachya (VIR-1856, Алжир) нескольких полиплоидных видов. Каждая последовательность секвенировалась в двух направлениях. Длина секвенированньгх фрагментов, включающих гены 18S рРНК (фрагмент), ITS 1,5.8S рРНК, ITS2,26S рРНК (фрагмент) составляла 667-668 нуклеотидов для каждого вида. Сравнение последовательностей показало, что все исследованные нами представители Avena, кроме A. macrostahya, судя по последовательностям ITS1 и ITS2, представляют собой компактную, хорошо поддерживаемую при bootstrap-анализе, филу. Из исследованных в этом отношении злаков, представителей других родов, к Avena ближе всего Calamagrostis.

 

Тюпа Н.Б.1, Ким Е.С.1, Ефимов A.M.1, Лоскутов И.Г.2, Родионов А.В.1

1Ботанический институт им. В.Л. Комарова РАН, Санкт-Петербург

2Всероссийский институт растениеводства им. Н.И. Вавилова РАСХН, Санкт-Петербург