Вы здесь

Главная

Разнообразие генетических систем биодеградации нафталина у штаммов флуоресцирующих псевдомонад

ID_Статьи: 
35.00

Полициклические ароматические углеводороды (ПАУ) являются одними из широко распространенных соединений, загрязняющих окружающую среду. Микробная деградация является основным процессом, приводящим к утилизации ПАУ в природных условиях. Изучение разнообразия генетических систем деградации ПАУ представляет несомненный интерес. Исследованы 13 штаммов - деструкторов нафталина из коллекции лаборатории, выделенные из различных регионов Российской Федерации. На основе анализа 16S рДНК все штаммы были предварительно отнесены к Pseudomonas fluorescens. Ключевые гены деградации нафталина (nahAc и nahG) амплифицировали и проводили рестрикционный анализ ПЦР-продуктов. В трех штаммах последовательность nahAc аналогична последовательности doxB штамма Pseudomonas sp. С18 и nahAc P. putida G7; в трех - последовательности штамма P. stutzeri AN 10, последовательности nahAc остальных исследованных штаммов не похожи ни на один известный тип nahAc - подобных генов. В штаммах 1-16, А24, А87, А88 и А96 обнаружено одновременное сосуществование двух различных генов nahAc. Анализ nahG - ампликонов показал, что ген салицилат гидроксилазы штамма А24 аналогичен nahG архетипической плазмиды NAH7; в трех исследованных штаммах nahG аналогичен pDTGl; еще в трех - аналогичен хромосомному nahG штамма AN 10; в двух - хромосомному nahG Р. putida KF715. Рестрикционный анализ амплифицированных ДНК-фрагментов nahG штаммов А87, А88 и А96 показал, что в них содержится новая последовательность гена nahG, не описанная ранее. Таким образом, продемонстрирована значительная вариабельность генетических систем биодеградации ПАУ, которая повышает адаптационные возможности микроорганизмов и обеспечивает распространение катаболических генов в микробных популяциях.

 

Измалкова Т.Ю.1, Сазонова О.И.2, Кошелева И.А.1

1 Институт биохимии и физиологии микроорганизмов им. Т.К. Скрябина РАН, г. Пущино

2 Кубанский государственный университет, г. Краснодар