Вы здесь

Главная

Применение биокомпьютерных методов для поиска и анализа регуляторных последовательностей в некодирующих участках хромосомного гена церулоплазмина

ID_Статьи: 
29.00

Церулоплазмин (ЦП) - основной медьсодержащий белок позвоночных, относится к категории "moonlighting" (работающих по совместительству) белков. С целью оценить потенциальные кодирующие возможности уникального гена ЦП в работе использовали методы компьютерного анализа. Структура хромосомных генов ЦП известна только у человека, крысы и мыши, поэтому сравнение интронов велось между этими тремя видами. Интрон 16 трёх исследованных видов содержит потециальные сайты тканеспецифической регуляции транскрипции CdxA, которые функционируют только в эмбриональный период онтогенеза. По два таких цис-элемента находятся в одинаковых положениях с практически полным совпадением последовательностей. В интроне 8 был найден потенциальный промотор гена ЦП человека, который в единственной рамке считывания программирует синтез полипептидной цепи длиной 582 а.о. (1746 п.н.), полностью соответствующий ЦП человека с 502 а.о. и имеет на М-конце 18 а.о., которых нет в ЦП. Анализ этой N-концевой последовательности показал, что она обеспечивает белку цитоплазматическую локализацию. Только З'-UTR ЦП-мРНК человека содержит цис-элемент, необходимый для подавления экспрессии гена ЦП на уровне трансляции, которое осуществляется белком, индуцируемым гамма-интерфероном. Сходные, но низкогомологичные с цис-элементом человека структуры были выявлены у барана, крысы и мыши. ЦП-мРНК человека содержит альтернативный сайт полиаденилирования в 5'-направлении от этого цис-элемета. В результате проведённого анализа выявлено, что хромосомный ген ЦП человека кодирует потенциальную цитозольную форму ЦП человека, соответствующего С-концевой половине ЦП и экспрессия гена ЦП может тканеспецифично осуществляться на уровне трансляции.

 

Клотченко С.А.1, Платонова Н.А.2

1Санкт-Петербургский Государственный Политехнический Университет, Санкт-Петербург (Россия)

2Научно-Исследовательский Институт Экспериментальной Медицины PAMiH, Санкт-Петербург (Россия).