Вы здесь

Главная

Некоторые свойства интронов и экзонов в генах ядерного генома Arabidopsjs thaliana

ID_Статьи: 
2.00

Ядерный геном клеток эукариот содержит значительную долю генов с нитронами. Увеличение числа интронов в генах вероятно связано с выполнением ими определенных биологических функций, часть которых остается неизвестной. Нами изучены в сравнительном аспекте свойства экзонов и интронов в ядерных генах A. thaliana. По мере увеличения числа интронов в генах уменьшается средняя длина экзонов и интронов. В генах с одним интроном доля экзонов составляет 78% и в генах с 15 и более интронами она равна 52% и становится одинаковой с общей длиной интронов. Средняя длина генов с одним интроном равна 1099 п.н. и в группе генов с 15 и более интронами она равна 6151 п.н. Увеличение числа интронов в генах происходит с одновременным уменьшением' доли интронов и экзонов с длиной более 400 п.н. Доля интронов в интервале длины 80-100 п.н. возрастает до 37% и доля экзонов в интервале 60-120 п.н. - до 49%. Частоты встречаемости нуклеотидов (fA, FT, fG, fC) в интронах и экзонах заметно отличаются. Во всех генах, содержащих интроны, GC-содержание меньше, чем в экзонах за счет низкого GC-содержания в интронах. Величина соотношения частот встречаемости нуклеотидов (fA fC/fG) и доля пуриновых нуклеотидов (fA+fG-0,5) в экзонах больше, чем в генах с интронами. Следовательно, интроны приближают величины (fA/fT-fC/fG) и (fA+fG-0,5) к нулю и оптимизируют гидрофобно-гидрофильный баланс однонитевой ДНК. Около 8% генов A. thaliana имеют частоту встречаемости CG-динуклеотидов в два и более раз ниже, чем в среднем по всем генам. Интроны и экзоны в этих генах имеют равную частоту использования CG-динуклеотидов и, следовательно, интроны по этому свойству соответствуют экзонам. Для всех генов 2-й и 4-й хромосом рассчитаны коэффициенты элонгации (КЭ) соответствующих мРНК. Гены с высокими и низкими КЭ содержат в среднем соответственно 1,0 и 1,7 интронов, а гены со средними КЭ - 5,3 интронов. Полученные данные показывают, что наличие интронов в генах часто связано с существенными отличиями свойств генов.

 

Атамбаева Ш.А., Хайленко В.А.

Казахский национальный университет им. аль-Фараби, Алматы (Казахстан)