Вы здесь

Главная

Изучение взаимодействия цитоплазматического участка CD150 с SH2-доменами

ID_Статьи: 
1.00

Цитоплазматический домен CD 150 (CD150ct) содержит два ITSM-мотива 279TIYAQV и 325TVYASV. Пространственная структура CDlSOct еще не определена экспериментально. Поэтому нами была построена модель CDlSOct по 2gn5-матрице (РНКсвязывающий белок фага fd). Модель имеет V-образную форму, и мы предположили, что она иллюстрирует связанное состояние CDlSOct. Исследования проводились методом докинга макромолекул. Для этого использовали программу Hex 2.4. CD150ct локировали с адапторным белком SH2D1А и SH2-содержащей тирозин-фосфатазой SHP-2. При отборе комплексов руководствовались прежде всего экспериментальными даными, полученными в нашей лаборатории, а также рентгенограммами SH2-домеков в комплексе с различными фосфорилироваными и нефосфорилированными пептидами.

Показано, что 279TIYAQV~mothb CDlSOct связывается с щелью, образованной вС и bD нитями SH2D1A. BG и EF петли захватывают колено V-формы. С SH2D1A связываются обе «ветви» V-формы, но при этом pY327 остается экспонированным. Вторая ветвь V-формы тоже связывается при участии BG и EF петель, но 325TVpYASV-mothb взаимодействует с 6В спиралью. Расчет потенциальной энергии свидетельствует, что аффинность связывания SH2D1A с pY327 ниже, чем с Y281. При взаимодействии CD150ct с N-концевым SH2-доменом SHP-2 нами показана возможность связывания pY обоих ITSM. хотя высокое стерическое соответствие и отсутствие електростатических препятствий свидетельствует о большей аффиности при связывании с pY327.

Поскольку SH2DJA и SHP-2 могут использовать для присоединения к CDlSOct как Y281, так и Y327, с CD150ct могут связываться как одна, так и две молекулы SH2D1A и/или SHP-2 одновременно. Связывание с SHP-2 pY327 CD150ct может влиять на конформацию вВ и вЕ петель, образующих стенки активного центра фосфатазного домена. В то же время SH2D1A и SHP-2 различаются по аффинности связывания с Y281 и Y327.

 

Акимов Ю.Н., Сидоренко С.П.

Институт экспериментальной патологии, онкологии и радиобиологии им. Р.Е. Кавецкого НАНУ, Киев (Украина)