Вы здесь

Главная

Изучение структуры гена СКАР2 (LB1), вовлеченного в процессы онкогенеза человека

ID_Статьи: 
135.00

Описана структура гена СКАР2 человека, кодирующего белок, ассоциирован­ный с цитоскелетом (cytoskeleton associated protein 2), и вовлеченного в процессы онкогенеза. Повышенная транскрипционная активность этого гена, кДНК которого получила обозначение LB1, была обнаружена при изучении экспрессии мРНК в семенниках, тимусе и в клетках В-клеточных лимфом диффузного типа. Ранее нами было показано, что ген СКАР2 локализован на границе облас­тей 13ql4.3 и 13q21.1, часто перестраиваемых в различных опухолях. Структура гена установлена на основе сравнения нуклеотидной последовательности кДНК гена СКАР2 с геномной последовательностью клона AL359514, построения эк-зон-интронной структуры гена с помощью программы GENSCAN и на основе экспериментальных данных, полученных амплификацией фрагментов гена. По­казано, что ген СКАР2 состоит из девяти экзонов длиной от 70 до 1442 п.н., а общая протяженность гена СКАР2, включая регуляторные области, составляет около 22 т.п.н. Промоторная область гена содержит не канонический ТАТА-бокс, а ССААТ-элемент в позициях -39 -33. Кроме того, в промоторной области гена выявлено девять сайтов связывания для шести факторов транскрипции (ATF, Spl, СР1, ICSBP, E4F1, Oct-l). Таким образом, исследованная последовательность содержит все необходимые структурные элементы присущие генам эукариот. Структура гена СКАР2 зарегистрирована в базе данных EMBL (AccN AJ429398). Установление структуры гена СКАР2, включая промоторную область, позволяет использовать эти данные для последующего исследования экспрессии гена в норме и различных опухолях и выяснения его роли в процессах онкогенеза.

 

Рахманалиев Э.Р., Климов Е.А.

Институт общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН, Москва