Вы здесь

Главная

Использование нуклеотидов в генах субъединиц рибулозодифосфаткарбоксилазы и АТФ-синтазы

ID_Статьи: 
47.00

Считается, что особых ограничений на замены нуклеотидов в 3-м-положении-кодонов нет, что подтверждается данными о повышенной частоте этих замен. Недавно установлено ограничение на частоту использования нуклеотидов в одноцепочечной ДНК, в том числе и в генах белков, которое отражается уравнением линейной регрессии. В связи с этим нами изучены гомологичные гены субъединиц рибулозодифосфаткарбоксилазы (РДФК) и АТФ-синтазы с целью выявления ограничений на частоту встречаемости нуклеотидов в различных положениях кодонов. Анализ частоты использования нуклеотидов (fA, fT, fC, Ю) в первых двух положениях кодонов генов rbcS из ядерных геномов 52 объектов показал, что все гены хорошо удовлетворяют закономерности отражаемой уравнением линейной регрессии. Частота использования нуклеотидов в третьем положении кодонов тоже хорошо соответствовала этой закономерности. В целом гены rbcS по частоте использования нуклеотидов лучше соответствуют линейной регрессии. Анализ частоты использования нуклеотидов в гомологичных генах rbcL локализованных в геноме хлоропластов 130 объектов, проведенный по той же схеме, что и для генов rbcS, показал, что для этих генов справедливы те же закономерности. Анализ частот использования нуклеотидов в генах субъединиц А, В, D, Е, F, G, Н и I АТФ-синтазы, локализованных в геномах хлоропластов, митохондрий и бактерий, показал, что нуклеотиды в 3-м положении кодонов используются так, чтобы в целом ген по составу нуклеотидов в большей степени соответствовал линейной регрессии, характерной для белоккодирующих генов с использованием всех смысловых кодонов генетического кода. Результаты настоящей работы свидетельствуют, что замены нуклеотидов в 3-м положении кодонов, не произвольны, а ограничены закономерностью отражаемой уравнением линейной регрессии. Использование синонимических кодонов позволяет сохранять, кодирование инвариантных аминокислот в гомологичных генах, и за счет нуклеотида в 3-м положении адаптироваться генам к геномам с разным (G+C-содёржанием.

 

Габдудина Ж.Б., Иващенко Т.А.

Казахский национальный университет им.аль-Фараби, Алматы, (Казахстан).