Вы здесь

Главная

Единичные нуклеотидные замены в интроне 2 гена K-ras мыши, ассоциированные с развитием рака легких

ID_Статьи: 
51.00

Ген K-ras является одной из наиболее перспективных моделей для изучения наследственной предрасположенности к опухолям легких, поскольку он идентифицирован как ген, детерминирующий чувствительность к пульманоканцерогенезу, и у человека и у экспериментальных животных. В результате генотипирования ряда инбредных линий мышей была установлена связь между единичными нуклеотидными заменами (Single nucleotide polymorphisms, SNPs) во интроне 2 гена K-ras и предрасположенностью к спонтанному и химически индуцированному раку легких.

С использованием синтезированных двуцепочечных олигонуклеотидов, охватывающих область от 278 до 307 п.н. интрона 2 гена K-ras мыши и воспроизводящих «чувствительный» СА, "устойчивый" GC и "промежуточный" СС варианты SNP, методом задержки ДНК-пробы в геле показано, что в случае «чувствительного» СА варианта наблюдается дополнительная полоса задержки по сравнению с "устойчивым" GC и "промежуточным" СС аллелями. Установлено, что данная полоса представляет комплекс олигонуклеотидного зонда с фактором транскрипции GATA-6, который является ключевым регуляторным белком для дифференцировки легочной ткани. Таким образом, в случае «устойчивого « GC и «промежуточного» СС вариантов SNP сайт связывания GATA-6 оказывается разрушенным. С использованием того же метода найден сайт связывания GATA-6 в районе 12 кодона гена K-ras, мутации в котором инициируют развитие опухолей легких. Исследования по анализу структуры хроматина показали, что район полиморфизма в интроне 2 и отстоящий от него на расстоянии 250 п.н. район 12-ого кодона гена K-Ras характеризуются тканеспецифичной гиперчувствительностью к действию ДНКазы I: сайты гиперчувствительности наблюдаются в легких, а в селезенке отсутствуют. Полученные данные свидетельствуют о функциональной значимости исследованных участков.

 

Горшкова Е.В., Меркулова Т.И.

Институт цитологии и генетики СО РАН, Новосибирск (Россия)